Филогенетическое родство эндонуклеазы Eco29kI с хоминг-эндонуклеазами

Представленная работа является началом исследованияструктурно-функциональных взаимосвязей эндонуклеазрестрикции с известными классами “хоминг”-эндонуклеаз. В настоящем исследовании впервыеописан каталитический центр эндонуклеазы рестрикцииEco29kI типа II, а также изучены ДНК-связывающие икаталитические свойства этого фермента. Наосновании полученных данных впервые предложенмеханизм катализа ДНК эндонуклеазой Eco29kI.Полученные в ходе исследования знания опринципиально новой структурной организациикаталитического центра эндонуклеазы Eco29kI посравнению с известными эндонуклеазами типа IIвносят значимый вклад в фундаментальныеисследования в области молекулярной биологииферментов рестрикции ДНК. А также значительнорасширяют наши представления о разнообразииструктур эндонуклеаз рестрикции, способствуютуглублению нашего понимания деталей ДНК-белковыхвзаимодействий и предполагают дивергентный путьразвития разных классов фосфодиэстераз. Аиспользуемый в данной работе алгоритм исследованияпозволяет описывать структуру и механизм катализаэндонуклеаз, которые в силу определенных причинне могут быть изученырентгеноструктурным анализом.