Транскрипционная активность в генетических локусах E.coli

Регуляция экспрессии бактериальных генов может осуществляться на нескольких функциональных уровнях. В первую очередь, в процессе инициации транскрипции. Традиционно считается, что эффективность синтеза РНК контролируется белками – активаторами и репрессорами – общее число которых в бактериальной клетке может быть около 300. Кроме того, существует еще один класс регуляторов – малые нетранслируемые РНК. Их размер варьирует от 37 до 400 нуклеотидов, а механизмы действия очень разнообразны. Для E.coli в настоящее время изучено 87 регуляторных РНК, большая часть которых кодируется независимыми генами. Данные системного анализа позволяют предположить, что общее их количество в клетке гораздо больше, чем белковых регуляторов транскрипции. При этом только 10 известных нетранслируемых РНК транскрибируются из кодирующих последовательностей в антисмысловом направлении. Образуя комплементарные дуплексы с мРНК вблизи инициирующего кодона, они влияют на их ассоциацию с рибосомами и, следовательно, модулируют синтез белкового продукта. При связывании с другими участками матричной РНК, аРНК могут изменять их стабильность, поддерживая относительное содержание мРНК на оптимальном уровне.