Моделирование взаимодействия антимикробных пептидов с мембранами

Возрастающая устойчивость патогенных микроорганизмов к используемым антибиотикам является серьезной медицинской и производственной проблемой. В связи с этим весьма актуальным становится исследование новых антимикробных агентов, в частности, мембран-активных пептидов с целью создания препаратов нового поколения с заданной активностью и селективностью. Среди мембран активных пептидов особой популярностью пользуются пептаиболы. Они взаимодействуют с клеточной мембраной и образуют ионный каналы, тем самым, нарушая электро-химический баланс клетки. В данной работе изучается представитель класса пептаиболов зервамицин IIB, выделяемый из Emericellopsis salmosynnemata. На основе полученной методом двумерного ЯМР структуры молекулы было проведено сравнительное изучение взаимодействия молекулы зервамицина IIB с модельными мембранами прокариот и эукариот. На последней стадии были сконструированы и изучены три модели зервамицинового канала, состоящие из четырех, пяти и шести молекул пептида.